Doktorand Bioinformatik - Datenanalyse (m/w/d) - #2697418

Das Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften - ISAS - e.V. entwickelt Analyseverfahren für die Gesundheitsforschung. Mit seinen Innovationen trägt es dazu bei, die Prävention, Frühdiagnose und Therapie von beispielsweise Herz-Kreislauf-Erkrankungen oder Krebs zu verbessern. Ziel des Instituts ist es, die personalisierte Therapie voranzutreiben. Dafür kombiniert das ISAS Wissen aus Biologie, Chemie, Informatik, Medizin, Pharmakologie und Physik. Das ISAS ist Mitglied der Leibniz-Gemeinschaft und wird durch die Bundesrepublik Deutschland und ihre Länder öffentlich gefördert.

In der Abteilung Bioanalytik suchen wir für die Arbeitsgruppe Mehrdimensionale OMICS-Datenanalyse:

Doktorand:in (m/w/d)

Diese Stelle ist Teil des Leibniz-WissenschaftsCampus „Cardio-Oncology Campus for Precision Medicine“ mit Fokus auf die Analyse und Entwicklung von Biomarker-Profilen zur personalisierten Bewertung von Krebstherapie-vermittelten kardiovaskulären Risiken.

Die Vollzeitstelle ist ab sofort verfügbar und zunächst befristet bis 30.09.2030. Die Stelle wird entsprechend des TV-L vergütet und ist mit der Entgeltgruppe 13 bewertet. Die Befristung des Vertrages richtet sich nach dem Wissenschaftszeitvertragsgesetz (WissZeitVG).

Frauen werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt berücksichtigt, sofern Frauen in der jeweiligen Organisationseinheit unterrepräsentiert sind und nicht in der Person eines Mitbewerbers liegende Gründe überwiegen. Bewerbungen von für die Position qualifizierten schwerbehinderten oder diesen gleichgestellten Personen werden ausdrücklich begrüßt.

Aufgaben

• Analyse von phänotypischen, mikroskopischen, PET/MRI, MALDI MSI und LC-MS/MS Daten
• Entwicklung von KI-basierten Modellen zur personalisierten Risikobewertung
• Validierung und Anwendung der Modell-Performance anhand etablierter Biomarker und Patient:innenkohorten
• Auswertung, Analyse und Visualisierung der Daten
• Dokumentation der Laborarbeiten
• Zusammenarbeit mit den Projektpartnern und regelmäßige Präsentation der Ergebnisse
  
  

Qualifikationsprofil

• M.Sc. oder Diplom im Bereich Bioinformatik oder vergleichbare Qualifikation
• Umfassende Programmiererfahrung
• Praktische Erfahrung im Bereich maschinelles Lernen und der Anwendung von large language models
• Kenntnisse bezüglich OMICS- und Bilddatenanalyse
• Bereitschaft zum interdisziplinären wissenschaftlichen Arbeiten, Teamfähigkeit, Aufgeschlossenheit und Engagement werden vorausgesetzt
• Kommunikationsstärke, Organisationstalent und eine lösungsorientierte Arbeitsweise
• Sicherer Umgang mit MS Office
• Bereitschaft zu Dienstreisen
• Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift; Deutsch von Vorteil
  
  

Wir bieten

• Ein klares Forschungsthema sowie eine vielseitige Ausbildung und Betreuung von Doktoranden am ISAS und im Rahmen der Leibniz-Gemeinschaft
• Fortbildungs- und wissenschaftliche Entwicklungsmöglichkeiten in einem internationalen Umfeld und eine hervorragende Arbeitsatmosphäre in einem sehr dynamischen und professionellen Team
• Umfangreiche Ausstattung und Infrastruktur auf dem neuesten Stand der Technik in verschiedenen analytischen Methoden
• Die Möglichkeit, Ihre Daten auf internationalen Konferenzen zu präsentieren und an Workshops teilzunehmen
• Flexible Arbeitszeiten, mobiles Arbeiten und attraktive Sozialleistungen
• Familienfreundliche Infrastruktur und Unterstützung durch einen Familienservice